Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms