Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AMFRQ9UKV5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms