Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms