Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms