Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-18Q9QC07 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-18Q9QC07 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms