Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IGSF9Q9P2J2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms