Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EHD3Q9NZN3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms