Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP39A1Q9NYL5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP39A1Q9NYL5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms