Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms