Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC3Q9NUD5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms