Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms