Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTN4Q9NQC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms