Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBE2TQ9NPD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2TQ9NPD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms