Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC86Q9H6F5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms