Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR12Q9C0I1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms