Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
EDEM3Q9BZQ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms