Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCGF6Q9BYE7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms