Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIOK2Q9BVS4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIOK2Q9BVS4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms