Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms