Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRACR2AQ9BSW2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms