Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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