Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PITX2Q99697 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX2Q99697 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms