Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP4Q96PP9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms