Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms