Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF354BQ96LW1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms