Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC136Q96JN2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC136Q96JN2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms