Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms