Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD50Q92878 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD50Q92878 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms