Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3AQ92664 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF3AQ92664 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms