Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms