Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HAPLN4Q86UW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HAPLN4Q86UW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms