Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREML4Q6UXN2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREML4Q6UXN2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms