Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms