Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP4Q6PIL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms