Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC174Q6PII3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms