Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF6Q6KF10 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF6Q6KF10 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms