Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ABLIM2Q6H8Q1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms