Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPI1

CTRB2, Chymotrypsinogen B2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB2Q6GPI1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRB2Q6GPI1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRB2Q6GPI1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRB2Q6GPI1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRB2Q6GPI1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRB2Q6GPI1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTRB2Q6GPI1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTRB2Q6GPI1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms