Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATG16L1Q676U5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms