Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BROXQ5VW32 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms