Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HIVEP3Q5T1R4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIVEP3Q5T1R4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms