Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC38Q502W7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms