Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms