Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KRTAP24-1Q3LI83 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms