Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD55Q3KP44 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms