Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P3H1Q32P28 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P3H1Q32P28 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms