Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms