Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SGCAQ16586 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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SGCAQ16586 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SGCAQ16586 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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