Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX1Q16384 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SSX1Q16384 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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