Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNA6Q15825 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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